使用除草剂对土壤的危害有：可以使土壤酸性化；使土壤中氮磷钾钙等养分降低 ， 使农作物的产量受到影响；导致土壤中的空隙度变小 ， 从而造成土壤出现板结现象等 。
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除草剂有一定的副作用 ， 在使用过程中会产生很多危害 。 农田喷施除草剂后 ， 不被杂草吸收的的除草剂成分会游离存在于土壤中 ， 不利于农作物生产 ， 比如会使农作物减产 ， 使农作物出现畸形现象 ， 影响农作物的下一代作物 。 除草剂不止会造成环境污染 ， 也会间接对人体造成伤害 。 并且农作物会吸收并积蓄除草剂 ， 最终人体食用这些农作物 ， 会危害人体的健康 。
据估计 ， 美国与化学除草剂有关的癌症患者数约占全国癌症患者总数的20% 。 严重者甚至影响胎儿的畸形发育 。
【【土壤】除草剂对土壤的危害】
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